| F+E-Vorhaben Monetäre CO2-Bilanzierung von ausgewählten Naturschutzgebieten | 2009 - 2010 |
| F+E-Vorhaben Berichterstattung nationaler Biodiversitätsindikatoren | 2009 - 2010 |
| Methodentest Bechstein-Fledermaus | 2009 |
| Auswertung der Biotopkartierung für ausgewählte Probequadrate des bundesweiten Brutvogelmonitorings in Bayern | 2008 - 2009 |
| F+E-Vorhaben Umsetzung des HNV-farmland-Indikators | 2008 - 2010 |
| Beratung zum FFH-Monitoring | 2008 - 2009 |
| F+E-Vorhaben Biotopverbundachsen im europäischen Kontext | 2008 - 2010 |
| F+E-Vorhaben Entwicklung des High-Nature-Value (HNV) Farmland Indikators | 2007 - 2008 |
| F+E-Vorhaben Indikatoren für die nationale Strategie zur biologischen Vielfalt | 2007 - 2009 |
| F+E Vorhaben Zusammenstellung und Aufbereitung der Daten der Bundesländer für den Bericht gemäß Art. 17 der FFH-RL | 2006 - 2009 |
| Artenhilfsprogramm Kreuzkröte | 2006 |
| Erfolgskontrolle von Maßnahmen im NSG Prunn | 2006 |
| F+E Vorhaben Konzeption des FFH-Monitorings | 2005 - 2008 |
| Abgleich Monitoring-Inhalte FFH-Arten und Indikator Besondere Arten | 2005 |
| F+E Vorhaben Länderübergreifende Achsen des Biotopverbunds | 2004 - 2007 |
| Etablierung des Indikators Besondere Arten | 2004 |
| Zoologische Erfolgskontrolle auf Pflegeflächen der Biologischen Station Straß | 2004 - 2005 |
| Einfluss der Teichwirtschaft auf Amphibien | 2003 - 2004 |
| Entwicklung eines Vogelmonitorings für Bayern | 2003 |
| Rahmenkonzepte für die Umsetzung des Artenhilfsprogrammes Flussperlmuschel für Kleine Ohe und Schwarzach | 2002 |
| Leitfaden Erfolgskontrolle für Hochmoore | 2001 - 2002 |
| Entwicklung eines Indikatorenkonzeptes Naturschutz | 2001 - 2004 |
| Dauerbeobachtung Neunerberg | 2000 - 2007 |
| Artenhilfskonzept Flussperlmuschel | 2000 - 2003 |
| Auswertung von Bestandszählungen des Feldhasens | 1999 |
| Artenhilfsprogramm Äsche - historische Analyse | 1999 |